Botka Endre felesége Alexandra, akit 2017 őszén jegyzett el a Ferencváros és a magyar válogatott védője. 2019 tavaszán összeházasodtak, majd év végén megszületett az ifjabbik Endre, aki bearanyozza a focista és kedvese mindennapjait. A labdarúgó elmondása szerint: „Álmomban sem gondoltam volna, hogy édesapának lenni ilyen nagyszerű érzés. Rengeteg pluszenergiát ad
